Embora peixes e répteis compartilhem algumas características, os peixes não são répteis. A diferença mais importante entre os dois grupos de animais é que os peixes usam guelras para respirar, enquanto os répteis usam pulmões.
Peixes e répteis são vertebrados, o que significa que têm espinha dorsal, e a maioria das espécies tem sangue frio. Os répteis vivem na terra e na água, enquanto os peixes vivem exclusivamente na água. Além disso, todos os répteis têm escamas, mas apenas alguns peixes têm escamas. Os répteis incluem crocodilos, cobras, lagartos e tartarugas marinhas. Os peixes incluem peixes ósseos, como salmão e truta; peixes cartilaginosos, como tubarões e patins; e lampreias e peixes-bruxa.