A página inicial do PubMed fornece informações sobre o número de citações que abriga, bem como exemplos dos tipos de literatura que oferece e de qual entidade a literatura é coletada. Sob o título Usando PubMed estão links para um guia de início rápido, artigos completos, perguntas frequentes, tutoriais e uma ferramenta de pesquisa de ensaios clínicos. Informações adicionais na página inicial incluem o endereço do National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
Sob o título PubMed Tools estão links intitulados PubMed Mobile, Single Citation Matcher, Batch Citation Matcher, Clinical Queries e Topic-Specific Queries. O título More Resources oferece links para o banco de dados MeSH, diários do banco de dados NCBI, os programas Entrez Programming Utilities e LinkOut.
O título Getting Started na parte inferior da página inicial contém links para a educação do National Center for Biotechnology Information, um manual de ajuda do NCBI e um manual do NCBI. Um link para treinamento e aulas também está disponível, assim como um link para enviar dados.
No cabeçalho Recursos, os usuários encontram links com o título Chemicals & Bioassays, Data & Software, DNA & RNA, Domains & Structures e Genes & Expressions. Genética e Medicina, Genomas e Mapas, Homologia, Literatura e Proteínas são links adicionais.
A página inicial do PubMed oferece um link para escrever o help desk próximo ao canto inferior direito. Um link de contato está localizado no canto inferior esquerdo.
