A temperatura, o nível de pH e as concentrações da enzima e do substrato afetam a funcionalidade da enzima. Os inibidores químicos também podem afetar o funcionamento das enzimas e reduzir sua eficácia.
A temperatura afeta a energia cinética de qualquer molécula. Temperaturas mais altas fornecem mais energia cinética, aumentando as chances de colisões moleculares bem-sucedidas. Acima de uma temperatura ideal, a estrutura da enzima começa a se quebrar conforme as ligações moleculares são quebradas e o potencial de atividade catalítica é reduzido.
Assim como a temperatura, também existe um nível de pH ideal para a funcionalidade da enzima. Mudanças nos níveis de pH podem fazer ou quebrar ligações moleculares, mudando a forma das enzimas e impactando diretamente na eficácia da enzima.
A taxa de reações catalisadas por enzimas depende das concentrações da enzima e do substrato. A taxa da reação aumenta à medida que a concentração de qualquer um deles aumenta. A taxa de aumento cresce até que o sítio ativo esteja saturado com substrato. Se a concentração do substrato for alta e a temperatura e o pH forem mantidos em um nível consistente, a taxa de reação é diretamente proporcional à concentração da enzima.
Produtos químicos chamados inibidores podem reduzir ou mesmo interromper a atividade catalítica da enzima. Os inibidores direcionados ao local ativo ocupam o local ativo e competem com o substrato pelo local ativo. Outros inibidores, chamados de inibidores direcionados ao local não ativos, se ligam à estrutura da enzima e distorcem sua forma.
