Células endoteliais e células mesoteliais diferem em localização. O endotélio reveste os vasos sanguíneos e outros vasos em forma de tubo, enquanto o mesotélio cobre a superfície externa dos órgãos, de acordo com o Histology Learning Center da Boston University.
Ambas as células epiteliais escamosas simples são responsáveis por revestir as superfícies livres. As células do endotélio e as células do mesotélio também diferem na concentração do citoplasma. As células endoteliais geralmente têm pouco ou nenhum citoplasma presente entre os núcleos. As células mesoteliais tendem a ter muito mais citoplasma entre as estruturas.
O endotélio tem contato direto com o sangue e a linfa. As células endoteliais têm um núcleo central e repousam sobre uma membrana basal fibrosa. A estrutura do endotélio envolve múltiplas células sobrepostas para evitar o vazamento do vaso. O endotélio pode ser dividido em endotélio contínuo, fenestrado e descontínuo. O endotélio localizado nos vasos linfáticos age contra a infecção, drenando o fluido intersticial para fora das células e tecidos.
O mesotélio forma uma cobertura protetora ao redor de muitos órgãos vitais. O mesotélio está associado às cavidades internas do corpo, não ao sangue e à linfa. Como o endotélio, o mesotélio tem um núcleo central e fica sobre uma membrana basal. As células mesoteliais são subdivididas em diferentes tipos com base na localização e associação de órgãos. Tanto o endotélio quanto o mesotélio têm a espessura de uma única camada de células e são derivados da camada mesodérmica do embrião.