Microflora indígena é definida como a comunidade de microrganismos que vivem sobre ou em outro organismo vivo ou em um ambiente específico. Esses microrganismos incluem bactérias, algas e fungos.
O tecido animal saudável, como sangue e músculo, normalmente não tem microorganismos, mas há muitos lugares dentro e fora do corpo saudável onde os microorganismos estão sempre presentes, incluindo a pele, as membranas mucosas e o intestino trato. Essa flora normal, também chamada de "microbiota indígena", geralmente não é patogênica por natureza e, na maioria dos casos, traz benefícios ao hospedeiro. Na maior parte, a relação entre o hospedeiro e sua flora pode ser descrita como "mutualística". Enquanto o hospedeiro fornece à bactéria um suprimento constante de nutrientes e proteção do meio ambiente, a bactéria auxilia os processos digestivos do hospedeiro e ajuda a proteger o hospedeiro de ser infectado por micróbios patogênicos.
Os micróbios que habitam o corpo humano normal e saudável representam um grande número de células. O corpo humano é composto por cerca de 10 trilhões de células, mas de acordo com a revista Discover, o número de células bacterianas que o corpo hospeda está perto de 100 trilhões ou dez vezes mais. No entanto, como as células bacterianas são tão minúsculas, toda essa população microbiana encheria apenas um jarro de meio galão.
