Há apenas um predador documentado de jibóias-esmeralda: as águias de crista da Guiana. No entanto, muitas outras aves de rapina, como a harpia, certamente são capazes de matar e comer jibóias. Além disso, gatos grandes, como onças, provavelmente comem jibóias esmeraldas quando as encontram.
As principais formas pelas quais as boas da árvore esmeralda se protegem dos predadores incluem sua incrível camuflagem, hábitos arbóreos e ciclo de atividade noturna. As boas da árvore esmeralda são de cor verde profundo, mas também apresentam marcações variadas de branco, amarelo, cinza e azul. A coloração verde ajuda as cobras a se misturarem com a folhagem verde da copa da floresta tropical, enquanto as marcações coloridas ajudam a quebrar o contorno das cobras. Passando a maior parte do dia dormindo enrolada em um galho, a árvore esmeralda acorda depois de escurecer para caçar. Se atacadas por um predador, as jibóias da árvore esmeralda agarram-se tenazmente ao seu galho e atacam com força.
As jibóias da árvore esmeralda têm visão adequada, mas a principal forma de detectar predadores é através do cheiro. Usando suas línguas bifurcadas, as jibóias da árvore esmeralda podem cheirar predadores antes mesmo de estarem perto o suficiente para serem vistos. Boas da árvore esmeralda também usam seu excelente olfato para localizar, rastrear e capturar presas, como roedores e sapos.
