Acesso limitado a tecnologia de qualidade, baixo conhecimento de informática, isolamento social e a necessidade de autodisciplina são desvantagens ou possíveis problemas com ambientes de aprendizagem virtual. Como os cursos online são orientados por tecnologia de computador e Internet acesso, uma pessoa sem esses recursos tem um desafio de aprendizagem eficaz.
Embora a programação flexível seja um benefício importante do aprendizado online, a incapacidade de programar e regular o desempenho é uma desvantagem para alguns. Os alunos que carecem de motivação e autodisciplina normalmente lutam mais em um ambiente de aprendizagem virtual do que em uma sala de aula tradicional. Não há professores e colegas em posição de oferecer lembretes regulares sobre tarefas, projetos e testes. Os alunos devem ter um ritmo próprio e reservar tempo suficiente para realizar as atividades em sala de aula e as tarefas fora da sala de aula.
A interação limitada do instrutor e o isolamento de um grupo de aprendizagem também são desvantagens. Os instrutores geralmente tentam se comunicar por e-mail ou ferramenta de aprendizagem virtual. No entanto, é mais difícil garantir uma escuta e compreensão adequadas à distância. Além disso, leva mais tempo para interação e feedback por meio de ferramentas virtuais do que em uma troca presencial tradicional. O isolamento social pode ser um desafio para os alunos que prosperam na interação diária com os colegas e no conforto informal que vem com um ambiente de sala de aula tradicional.
