As desvantagens de usar sistemas especialistas incluem alto custo e um sistema complexo orientado por menus. Outras desvantagens incluem rigidez sem flexibilidade para mudar o ambiente, incapacidade de explicar a lógica por trás de algumas decisões e incapacidade de automatizar procedimentos complexos.
Um sistema especialista refere-se a um software desenvolvido para oferecer soluções para problemas ou substanciar incertezas que, de outra forma, exigiriam a consulta de especialistas. É um sistema baseado em computador que imita a capacidade de tomada de decisão de especialistas. Os sistemas especialistas tornaram-se possíveis devido aos avanços na tecnologia suportada por computador. Esses sistemas atuam em prol do ser humano, proporcionando-lhe conhecimento e assessoria plenos para facilitar a tomada de decisões. Os sistemas especialistas são amplamente aplicados em vários campos da sociedade, desde o fornecimento de instruções simples até a execução de tarefas complexas.
No entanto, a maior desvantagem do sistema especialista é a aquisição de conhecimento. Requer uma quantidade significativa de tempo para adquirir as habilidades necessárias para trabalhar com os aplicativos de software envolvidos. Ao contrário das tarefas realizadas por seres humanos, os sistemas especialistas não incorporam o bom senso na tomada de decisões. Eles também carecem de criatividade possuída por seres humanos.
Por outro lado, os sistemas especialistas apresentam vários benefícios, incluindo a capacidade de reter uma grande quantidade de informações que podem ser facilmente recuperadas sempre que necessário. Eles também centralizam o processo de tomada de decisão. O uso de sistemas especialistas ajuda a eliminar erros por meio do processo de automação.