Alguns exemplos de organismos dentro do domínio eubactéria são algas, E. coli e salmonela. Também conhecidas como bactérias verdadeiras, são organismos microscópicos, procarióticos, unicelulares sem núcleos que produzem seus alimentos por fotossíntese.
Embora algumas eubactérias sejam prejudiciais aos humanos e todos os patógenos bacterianos conhecidos sejam eubactérias, elas também podem ser úteis. As eubactérias são utilizadas na produção de vinhos, queijos e iogurtes e também fazem parte do processo utilizado nas estações de tratamento de efluentes. Esses organismos existem há mais de 3 bilhões de anos e, como resultado do oxigênio produzido em seu processo de fotossíntese, possibilitaram a sobrevivência de animais que respiram ar.