Algumas adaptações que as cobras fizeram para terem um corpo longo e sem membros são órgãos internos muito diferentes dos de outros animais. Por exemplo, um pulmão geralmente é muito maior do que o outro. Em algumas cobras, o pulmão menor quase não funciona.
Em vez de ficarem lado a lado, os rins, ovários e testículos estão dispostos um atrás do outro. O órgão direito geralmente está na frente do esquerdo e geralmente é o maior dos dois; esses órgãos também são alongados. Alguns órgãos, como a bexiga urinária, foram eliminados.
Uma vez que a cobra não tem membros para sua coluna vertebral apoiar, quase todas as suas muitas vértebras são semelhantes. Uma cobra pode ter até 400 vértebras e elas se interligam para tornar a coluna vertebral forte e a cobra extremamente flexível.
Uma das adaptações mais notáveis está na cabeça da cobra. Em vez de uma mandíbula sólida, a cobra tem ossos que estão fracamente unidos por ligamentos e podem se articular de forma a permitir que o animal engula presas muito maiores do que sua cabeça. Os dentes da cobra são feitos apenas para agarrar sua presa e não podem mastigar. Eles são dispostos frouxamente na cabeça, caem facilmente e são substituídos ao longo da vida do animal.