O reino Monera incluía bactérias e cianobactérias. Os sistemas de classificação mudam quando tecnologias como o sequenciamento de DNA fornecem novas informações sobre a relação entre os organismos. Um sistema de três domínios consistindo de Bactérias, Archaea e Eukarya suplantou o sistema de cinco reinos, e Monera está obsoleto.
Um sistema de classificação funcional divide os organismos por seus tipos de células, em vez de seus genomas. As bactérias pertencem aos procariontes, que se distinguem pela falta de um núcleo e organelas fechadas por membrana em suas células. A maioria dos procariontes são organismos unicelulares visíveis apenas ao microscópio. Eucariotos incluem protistas, fungos, plantas e animais. Arquéias são procariontes que compartilham algumas características com eucariotos, incluindo genes semelhantes.