Existem muitas teorias relacionadas ao desaparecimento dos Anasazi, mas não há evidências sólidas que forneçam um motivo específico. Suspeitava-se anteriormente que a seca no final dos anos 1200 os expulsou de suas casas antigas , mas mais descobertas mostraram que isso por si só não teria sido suficiente para expulsá-los.
A ideia de que essas pessoas desapareceram totalmente também é um nome impróprio. Os índios Pueblo modernos são descendentes diretos dessa raça de pessoas, então eles nunca desapareceram de verdade. As evidências mostram que os Anasazi podem ter optado por partir por estarem atolados na área por muito tempo e a terra ser usada em seus limites.
