Geralmente os mamíferos terrestres, a maioria dos esquilos tem a capacidade de nadar como um cachorro remar. Eles usam suas caudas longas e espessas para guiar, assim como um barco usa um leme. Normalmente, eles vão para a água apenas quando surge a necessidade.
Devido ao tamanho relativamente pequeno da maioria dos esquilos, eles não são os nadadores de maior distância e, ocasionalmente, eles se afogam se não chegarem à costa a tempo. Embora a maioria das raças, como o esquilo vermelho e o esquilo cinza oriental, seja capaz de nadar, o esquilo voador não consegue. Os flaps extras que permitem que os esquilos voadores planem no ar os impedem na água.
