Francesco Pizarro casou-se com Ines Huaylas Yupanqui e teve um filho com o nome de Francesca Pizarro Yupanqui. Sua data de nascimento é incerta, mas acredita-se que tenha sido entre 1471 e 1476. Francesco Pizarro morreu em 1548 .
Francesco Pizarro era um filho ilegítimo. Seu pai era um soldado espanhol e sua mãe uma serva servil. Ele se tornou um dos maiores conquistadores espanhóis e foi Marquês de la Conquista. Em 9 de abril de 1548, ele foi derrotado na luta contra as forças espanholas lideradas pelo vice-rei Pedro de la Gasca. Ele foi capturado e executado.