A fêmea do pato Muscovy é consideravelmente menor do que o macho e tem menos carúnculas, se houver, na face ou na base do bico. Carúnculas são as protuberâncias carnudas, vermelhas e verrucosas encontradas principalmente em homens.
As penas nos patos Muscovy machos são geralmente mais brilhantes, com as penas pretas exibindo uma tonalidade roxa ou verde. As penas femininas têm cores mais monótonas. Enquanto os patos almiscarados não grasnam como os outros patos, os machos assobiam quando ameaçados e as fêmeas verbalizam com um cacarejo suave ou churr (um zumbido agudo ou som trinado). Os machos têm pernas mais grossas e pés maiores do que as fêmeas.
