As esponjas usam produtos químicos principalmente para se proteger, e os produtos químicos são tóxicos ou têm gosto ruim. Isso não apenas evita a predação, mas também a competição, pois os produtos químicos que elas liberam evitam que outros organismos cresçam perto delas . As espécies individuais têm outras estratégias, como cavar em corais, rochas ou moluscos para obter proteção.
Outra estratégia que muitos corais usam para manter os predadores como estrelas do mar afastados é espalhar pequenos pedaços de seus elementos esqueléticos, chamados espículas, no fundo do mar. Eles podem se acumular em uma camada espessa, impedindo os predadores que precisam rastejar para alcançá-los. Nem todas as esponjas possuem um mecanismo de defesa direto. As esponjas de vidro não produzem toxinas, mas vivem nas profundezas do oceano, onde os predadores são raros.
Apesar de suas defesas, as esponjas só podem fazer movimentos leves, quando podem se mover. Eles são vulneráveis a quaisquer organismos que possam superar suas defesas e são presas de muitas espécies de tartarugas, peixes e invertebrados. As esponjas podem se beneficiar parcialmente da predação, no entanto, já que fragmentos de esponjas deixados por predadores podem frequentemente sobreviver e se restabelecer como organismos independentes. Sua organização extremamente simples em nível de célula significa que muitas vezes podem sobreviver até mesmo a danos graves causados por predadores ou efeitos ambientais.
