A baixa contagem de plaquetas pode ser causada por muitas infecções bacterianas, virais, fúngicas e parasitárias, incluindo erliquiose, uma doença transmitida por carrapatos. O vírus da cinomose canina é outra causa comum de baixa contagem de plaquetas.
Baixas contagens de plaquetas são geralmente causadas por uma condição chamada trombocitopenia imunomediada ou IMT. É uma doença auto-imune, o que significa que o sistema imunológico do corpo ataca suas próprias plaquetas sanguíneas. Ocasionalmente, pode ocorrer sem motivo aparente e também está relacionado a doenças não infecciosas, como câncer, ou como reação a certos medicamentos. Existem casos ocasionais de baixa contagem de plaquetas que não são causados por IMT, mas são raros e geralmente relacionados a doenças da medula óssea. Algumas raças, incluindo os Grandes Pirineus, podem ter baixa contagem de plaquetas devido a problemas congênitos.
As doenças transmitidas por carrapatos são uma das causas mais comuns de IMT. Além da erliquiose, os cães também podem contrair babesiose e anaplasmose por picadas de carrapatos e desenvolver IMT como uma reação. A febre maculosa das Montanhas Rochosas, causada por uma bactéria transmitida por carrapatos chamada Rickettsia rickettsii, é outra causa possível.
A tularemia é uma das infecções mais comuns que podem causar IMT e não é transmitida por carrapatos. Às vezes é chamada de febre do coelho porque eles são um vetor comum para ela, mas muitas espécies de mamíferos podem ser portadoras. Os humanos também podem ser afetados pela tularemia.