A variação de temperatura no deserto do Saara de dia para noite pode variar até 50 graus Fahrenheit. A temperatura média anual é de 86 F. Durante os meses mais quentes, as temperaturas variam de 100 F a mais 120 F. As temperaturas congelantes durante a noite são comuns durante o inverno.
A extrema secura do deserto do Saara é uma de suas características mais marcantes. Os níveis extremos de seca em áreas por todo o Deserto do Saara são causados principalmente pelos ventos alísios do nordeste, que absorvem toda a umidade disponível na área. Além disso, o deserto do Saara tem uma precipitação média anual de menos de 5 polegadas.