As raízes das plantas são estruturas desenvolvidas para extrair nutrientes e umidade do solo, enquanto os tubérculos servem como recipientes de armazenamento e como meio de propagação de novas plantas. As plantas formam tubérculos em suas raízes e em ambos os caules. Os tubérculos do caule contêm células-tronco que permitem que as plantas se reproduzam formando novos caules e folhas. Os tubérculos de raiz não são tubérculos verdadeiros, pois não têm células-tronco ou folhas removidas.
A batata comum é um tubérculo do caule. Quando as batatas são plantadas a partir da semente, os ramos crescem do caule perto do solo, geralmente perto o suficiente para que o solo eventualmente os cubra. Na natureza, esses tubérculos ficam dormentes durante o clima mais frio, então brotam à medida que o solo se aquece, eventualmente propagando a planta para formar novas plantas geneticamente idênticas. A base do tubérculo forma o sistema radicular, enquanto a parte superior forma os novos caules e folhas.
As batatas-doces são tubérculos de raiz. Eles se formam em rizomas ou raízes horizontais da planta. Os tubérculos radiculares consistem apenas em células radiculares. Para propagar tubérculos de raiz, cada planta requer uma parte da capa da raiz que forma novas células-tronco.
Cenouras, beterrabas e nabos são verdadeiras raízes e não tubérculos. Embora essas raízes modificadas armazenem energia, elas não propagam novas plantas.