Fatores abióticos são as partes não vivas de um ecossistema. Os fatores abióticos da Antártica são suas baixas temperaturas, pequena quantidade de precipitação e manto de gelo polar. Fatores abióticos trabalham com os fatores bióticos, ou vivos, para moldar o ecossistema.
A Antártica é um deserto polar. Recebe menos de 50 milímetros de precipitação por ano, e a umidade relativa cai para 0,03%. A Antártica mantém sua cobertura de gelo nessas condições porque muito pouco da neve e do gelo derrete ou se sublima. Em vez disso, continua a se acumular com o tempo, formando a espessa camada de gelo.
Além de seus habitats oceânicos e de manto de gelo, a Antártica tem um ecossistema próspero de lagos subaquáticos. Esses lagos são protegidos do frio pelo manto de gelo e não foram expostos à luz solar ou ao ar livre por pelo menos 120.000 anos. Algumas estimativas científicas indicam que sua formação remonta a um milhão de anos. Esses lagos formam o maior ecossistema inexplorado do mundo, cobrindo 9% da massa terrestre da Terra.
Confirma-se que arqueias e bactérias vivem nesses lagos, e acredita-se que as condições apóiem os protistas. Existe a possibilidade de que pequenos vermes e artrópodes possam sobreviver neste ecossistema, mas o suprimento de comida disponível nos lagos não sustentaria organismos maiores.
