Um fato sobre a hibernação dos morcegos é que apenas algumas espécies de morcegos hibernam no inverno. Enquanto outras espécies de morcegos migram para climas mais quentes devido à escassez de alimentos, alguns procuram abrigo em locais protegidos dos elementos, entram em estado de torpor e hibernam. As poucas espécies de morcegos que hibernam podem sobreviver à temperatura de congelamento e podem até tolerar ficar envolto em gelo.
Outro fato é que a maioria dos morcegos que hibernam se muda para casas isoladas, cavernas ou minas abandonadas onde são protegidos e têm menos chance de encontrar seus predadores. Durante sua hibernação, os morcegos geralmente são encontrados agrupados em tetos ou paredes de cavernas. Eles diminuem suas funções corporais, como frequência cardíaca, metabolismo e níveis respiratórios para níveis extremamente baixos, a fim de regular sua temperatura. Em um estado de torpor, a freqüência cardíaca de um morcego pode chegar a 10 batimentos por minuto; uma contagem tremendamente baixa quando comparada com a taxa de quase 600 bpm quando acordado e 1.300 bpm quando em vôo.
Como outros mamíferos em hibernação, os morcegos despertam espontaneamente do torpor nos períodos mais quentes do inverno. Esses períodos de excitação também são uma forma de eliminar metabólitos, urina ou ajustar suas temperaturas. Os morcegos também podem ser acordados devido à intervenção humana.
Morcegos em hibernação são extremamente bons em sobreviver a climas congelantes. Enquanto outros mamíferos podem morrer se suas temperaturas chegarem a 10 graus Celsius, os morcegos sobrevivem em climas tão baixos quanto zero graus Celsius. No final do período de hibernação, eles podem reaquecer seus corpos sem usar fontes externas por meio do calor criado internamente, algo comum entre os hibernadores.