Os morcegos vivem em regiões de seis continentes do globo em florestas, desertos, ambientes urbanos, cavernas e até casas de morcegos construídas por pessoas. Devido à sua capacidade de adaptação, essencialmente não há limite para onde um morcego pode viver.
Existem mais de 1.300 espécies de morcegos que vivem em diversos climas e ecossistemas em todo o mundo. Eles habitam pequenos espaços, como fendas em rochas ou árvores, e também podem ser vistos em áreas abertas perto de água doce e costeira. Além disso, os morcegos vivem em uma variedade de altitudes, incluindo as montanhas dos Andes peruanos e também ao nível do mar, como em muitas das ilhas do sudeste da Ásia. Embora os habitats dos morcegos sejam extensos, eles não são encontrados no Pólo Norte ou no Pólo Sul.