O Bispo Jones não é casado e tem um relacionamento de 16 anos com Loretta Jones. O bispo Jones afirmou que ele e Loretta são apenas amigos, mas Loretta expressou seus sentimentos sobre querer se casar no programa "Preacher of L.A." do Oxygen. O bispo Jones e Loretta também são parceiros de negócios e possuem um restaurante de culinária sulista chamado JJ's Bistro em Inglewood, Califórnia.
O bispo Jones e Loretta começaram um relacionamento em 1992, após seu divórcio de sua primeira esposa, Ruth Jones. Ele expressou sua relutância em se casar novamente devido ao seu primeiro divórcio, e afirma que Loretta sabia disso desde o início. O bispo Jones também afirmou que não há sexo envolvido em seu relacionamento com Loretta, e que eles são muito compatíveis. Embora o bispo Jones e Loretta não sejam casados, ela age como sua esposa em eventos públicos e no programa "Preachers of L.A."
Seu relacionamento com Loretta levantou muitas sobrancelhas porque ele se divorciou de sua esposa e está em um relacionamento de longa data com Loretta. O Bispo Noel Jones é o pastor titular da Igreja City of Refuge em Gardena, Califórnia. Jones tem três filhos adultos, chamados Noel II, Tifani e Eric, de seu primeiro casamento. Ele também foi romanticamente ligado a NeNe Leakes e a atriz LisaRaye McCoy.