As folhas de alecrim podem ficar amarelas por causa de questões culturais, moscas-brancas, praga da botrytis e ácaros-aranha. Problemas culturais são uma causa comum do amarelecimento das folhas do alecrim e ocorrem quando o sistema radicular da planta é muito grande para o recipiente em que ela foi plantada. Esse problema pode ser corrigido replantando o alecrim em um recipiente maior ou aparando as raízes.
Os ácaros se alimentam de folhas de alecrim, fazendo com que as folhas fiquem ou amarelem. Para remover os ácaros da planta, borrife água pressurizada por alguns dias para desalojá-los ou use um inseticida natural. As moscas-brancas podem se agrupar na parte inferior das folhas de alecrim para se alimentar da planta. Sacudir a planta pode remover as moscas brancas das folhas, ou os proprietários das plantas podem usar um inseticida natural. Um alecrim maduro não pode ser prejudicado por uma pequena infestação de mosca-branca; no entanto, uma planta mais jovem pode morrer ou ficar sujeita a mofo devido aos resíduos deixados pelas moscas brancas. A ferrugem da botrytis afeta as folhas mais velhas do alecrim, infectando-as com um fungo que as torna amarelas. O fungo Botrytis blight se desenvolve em áreas com má circulação de ar, alta umidade e tempo nublado. Plantas de alecrim infectadas devem ser destruídas para ajudar a prevenir a infecção de outras plantas próximas.