Os coiotes não são predadores de ponta e têm inimigos. Os lobos geralmente afastam ou matam coiotes que invadem seu território, então os coiotes tendem a evitar áreas onde vivem os lobos. Agricultores e pecuaristas costumam considerar os coiotes um incômodo e exterminar ativamente os coiotes, e algumas pessoas caçam coiotes para recreação.
Historicamente, os coiotes evitavam áreas onde viviam matilhas de lobos. No entanto, desde a dizimação dos lobos na maior parte de sua distribuição histórica, os coiotes expandiram muito seu alcance. Os coiotes agora são encontrados com mais frequência em áreas florestais e montanhosas, ao passo que antes essas regiões eram dominadas por lobos. Os coiotes também se expandiram para áreas mais urbanas, onde se alimentam de lixo e animais domésticos.