Coelhos selvagens são portadores de doenças associadas a parasitas e bactérias, de acordo com a House Rabbit Society. É importante ter cuidado ao manusear coelhos selvagens.
Uma das doenças mais comuns transmitidas por coelhos selvagens é a tularemia, também conhecida como febre do coelho. A tularemia é uma doença bacteriana que pode ser transmitida aos humanos. Pode ser contraída pelo contato com sangue ou tecido de animais infectados. As moscas dos cervos e os carrapatos também podem transmitir a tularemia. Os sintomas incluem úlceras de pele no ponto de infecção e gânglios linfáticos inchados.
Os coelhos também podem ser portadores de mixomatose, um tipo de varíola que afeta apenas coelhos. A doença por calicivírus, também conhecida como doença hemorrágica do coelho, é uma doença altamente contagiosa e fatal que afeta exclusivamente coelhos selvagens e domésticos.