Embora o silício elementar seja inerte e não seja inerentemente perigoso, certas formas processadas do elemento podem causar efeitos negativos à saúde. O silício cristalino irrita os olhos e causa inflamação da pele ao contato, enquanto a inalação da substância agrava as membranas mucosas do sistema respiratório.
Estudos sugerem que a exposição ocupacional regular ao silício cristalino e à sílica leva ao câncer de pulmão, bronquite, distúrbio obstrutivo pulmonar crônico e enfisema. Além disso, a exposição à sílica está associada a distúrbios autoimunes e renais, bem como a um aumento nas infecções por micobactérias. Muitas funções ocupacionais correm o risco de exposição regular ao silício, incluindo mineiros, trabalhadores da cerâmica, fabricantes de tijolos e outros que trabalham em indústrias baseadas em minerais.