Como outras raças de cães de brinquedo, os cães malteses são propensos a hipoglicemia ou pressão arterial baixa, portanto, devem ser alimentados com pequenas quantidades de uma ração de alta qualidade com poucos aditivos e enchimentos ao longo do dia. Idealmente, 40 a 50 por cento das calorias diárias de um maltês devem vir da carne.
Cães malteses nunca devem ser alimentados com restos de comida ou ossos. Restos de comida podem perturbar seus sensíveis sistemas digestivos, enquanto ossos cozidos podem lascar e ferir seus intestinos ou estômagos. Como os cães malteses têm apetites delicados, alguns donos preferem cozinhar as refeições caseiras, visando um equilíbrio entre carne, vegetais e amido. De preferência, 25 a 35 por cento das calorias diárias de um maltês devem vir de vegetais crus ou cozidos no vapor. Os 25 a 35 por cento restantes podem ser compostos de arroz branco ou integral, ou macarrão.
Ao comprar comida para cães, sugerimos marcas que anunciam quantidades moderadas de gordura animal e grandes quantidades de proteínas. Alimentos úmidos devem apresentar alto teor de umidade. A maioria dos alimentos secos contém grãos como recheio, o que não é recomendado, pois carnívoros como cães não precisam de grãos. Marcas que não usam subprodutos animais são ideais. Os cães não devem ser alimentados com nada que contenha soja; foi demonstrado que afeta negativamente seus sistemas endócrinos.