O ibuprofeno é relativamente apolar. Isso ocorre porque ele tem grupos alquil apolares e um anel benzeno que reduz a polaridade geral da molécula contribuída por seu grupo carboxila. Portanto, o ibuprofeno é apenas ligeiramente solúvel em água, dissolvendo 21 miligramas por litro de água a 25 graus Celsius.
A propriedade não polar do ibuprofeno o torna muito solúvel em álcool e na maioria dos solventes orgânicos. Para tornar o ibuprofeno mais solúvel e de ação mais rápida, ele pode ser misturado ao sal de lisina. Transformar o ibuprofeno em um gel e misturá-lo com um solvente como o 2-propanol, que tem maior polaridade, facilita a absorção através da camada interna polar da pele.