Os crocodilos vivem em cursos de água parada e rasos, como rios ou pântanos, em climas tropicais em toda a Ásia, África, Austrália e Américas. Algumas espécies de crocodilos preferem habitats de água salgada, enquanto outras preferem água doce.
Os crocodilos americanos e de Morelet, ambos encontrados nas regiões caribenhas da América do Norte e Central, podem ser encontrados principalmente em rios e pântanos de água salgada e doce. Os crocodilos americanos podem ser encontrados tanto ao norte quanto ao sul da Flórida.
Os crocodilos africanos, como o crocodilo de focinho delgado e o crocodilo do Nilo, tendem a preferir rios protegidos, manguezais e pântanos de água doce. O crocodilo do Nilo também é encontrado na África Subsaariana e em Madagascar.