Os lagartos, como muitos vertebrados, têm pulmões e um sistema respiratório que os permite respirar. Eles são diferentes dos mamíferos e das aves porque não têm um músculo diafragma e, em vez disso, respiram flexionando os músculos do corpo.
Uma vez que precisam usar os músculos para respirar, os lagartos normalmente prendem a respiração enquanto fazem atividades intensas. Alguns lagartos podem contornar essa limitação usando os músculos da garganta para puxar o ar para os pulmões durante a atividade.
Nem todos os répteis usam a respiração baseada nos músculos do corpo. Os crocodilos e as tartarugas desenvolveram diferentes métodos de respiração. Os crocodilos têm um diafragma que os permite inspirar ar, enquanto as tartarugas, cuja expansão pulmonar é limitada por suas conchas, têm uma fina camada de músculo que fica em seus pulmões e se expande e se contrai para inspirar ar.
