Os furacões podem devastar ecossistemas florestais e remover toda a foliação das copas das florestas e podem alterar os habitats tão drasticamente que as populações de animais indígenas sofrem como resultado. Espécies ameaçadas de extinção em habitats tropicais, estuarinos e costeiros correm risco especial quando ocorrem furacões.
Os ventos dos furacões causam o impacto ambiental mais visível. Voar sobre uma floresta tropical após um furacão muitas vezes revela que a camada de dossel se foi completamente, o que impacta a vida de pássaros e animais que antes usavam a área diretamente abaixo dessa cobertura como seu habitat. Áreas arborizadas, como pântanos e pântanos, sofrem uma destruição significativa à medida que os ventos arrancam e demolem as árvores.
Tempestades e chuvas consideráveis se combinam com os fortes ventos para ameaçar o suprimento de alimentos que está disponível para os animais remanescentes não mortos pela tempestade. Quando o furacão Hugo atingiu Porto Rico em 1989, metade dos papagaios porto-riquenhos restantes no mundo morreram na tempestade. O Cozumel Thrasher, que vive apenas na ilha mexicana de Cozumel, quase foi extinto depois que o furacão Gilbert atingiu a ilha em 1988.
Os furacões também mudam a forma das paisagens costeiras, deslocando grandes quantidades de areia. Furacões em 2004, 2005 e 2008 causaram grandes mudanças na costa do Golfo do México; entre os furacões Katrina e Rita, que ocorreram em 2005, cerca de 73 milhas quadradas de terra foram perdidas para o mar.
