Os rios são o principal corpo d'água encontrado nas florestas tropicais. Muitas florestas tropicais apresentam um grande rio que alimenta todo o ecossistema e muitos rios menores que drenam para o corpo d'água principal, como o rio Amazonas e seus muitos afluentes.
O rio mais famoso da floresta tropical é o Amazonas, que também é o maior rio do mundo em descarga de água com 7.381.000 pés cúbicos de descarga por segundo. O rio Amazonas tem de 1 a 6 milhas de largura durante a estação seca da floresta tropical, mas pode ter até 30 milhas de largura na estação chuvosa. É também o segundo maior rio do mundo e a maior bacia de drenagem.
