Os corações reptilianos, em grande parte semelhantes aos corações de anfíbios, têm três câmaras e fornecem separação moderada de sangue oxigenado e desoxigenado com seus dois átrios, um que recebe sangue oxigenado e outro que recebe sangue desoxigenado dos pulmões. O ventrículo do coração reptiliano ainda permite que o sangue oxigenado e desoxigenado se misture, o que significa que não é tão robusto ou eficiente quanto o coração de um mamífero.
A separação do sangue ocorre porque a chegada do sangue é cronometrada de forma independente através dos átrios. Se o sangue chegar através de ambos os átrios simultaneamente, a mistura ocorre, mas isso pode ser em maior ou menor grau, dependendo da temperatura corporal do animal e do estado de atividade.
Uma vez que o sangue atinge o cone arterial, ele é puxado para baixo pelos três canais do tronco arterial, a entrada para o sistema circulatório, e então passa a se mover pelo resto do corpo reptiliano. O cone leva a três sistemas distintos, o sistema tronco pulmonar e os sistemas tronco sistêmico direito e esquerdo.
Os corações dos mamíferos são voltados para a atividade constante e altos níveis de movimento e esforço, enquanto os corações dos répteis têm melhor desempenho em rajadas curtas e exigem que o animal descanse com frequência e trabalhe para controlar a temperatura corporal. Níveis mais baixos de oxigênio no sangue tornam os répteis lentos e propensos a dormir.
