Em janeiro de 2015, havia cerca de 2.000 macacos-aranha Yucatan em liberdade na Península de Yucatan. Existem apenas cerca de 300 a 400 macacos-aranha-lanudos restantes no mundo.
Estas são duas das nove espécies de macaco-aranha listadas pela União Internacional para a Conservação da Natureza (IUCN).
O macaco-aranha variegado ou marrom (Ateles hybridus) estava na lista da IUCN dos 25 primatas mais ameaçados do mundo, 2008-2010. Em 2015, a IUCN lista três espécies de macaco-aranha como criticamente ameaçadas de extinção, cinco espécies como ameaçadas de extinção e uma espécie como vulnerável.
As espécies de macacos-aranha estão ameaçadas principalmente devido à perda de habitat devido à agricultura e exploração madeireira, porque dependem de grandes áreas de floresta para sobreviver. Eles também são caçados como fonte de alimento para humanos.
