As vacas têm 60 cromossomos: um único par de cromossomos sexuais e 29 pares de autossomos. Semelhante a outros mamíferos, todas as fêmeas têm dois dos cromossomos X, e os machos têm um único Y e Cromossomo X.
De acordo com o Departamento de Ciência Animal e Avícola da Universidade de Saskatchewan, durante os estágios da gametogênese, os cromossomos da vaca passam por um processo de meiose. Isso resulta em uma célula reprodutiva principal que produz três corpos polares e um óvulo. A vaca contribui com apenas um dos cromossomos X no processo de meiose. Todos os cromossomos são em forma de lágrima e têm o centrômero no final, exceto os cromossomos sexuais, que apresentam o centrômero mais próximo ao meio do cromossomo.