O pterodáctilo médio tinha uma envergadura de asas de 3 pés e pesava entre 2 a 10 libras. Os pterodáctilos não eram dinossauros, embora ambos os grupos pertençam ao mesmo agrupamento científico, os arcossauros.
Os pterodáctilos eram répteis voadores com membranas semelhantes às dos morcegos que se estendiam por seus membros dianteiros. Embora algumas pessoas possam usar os termos "pterodáctilo" e "pterossauro" alternadamente, os pterossauros eram o grupo abrangente do qual os pterodáctilos eram meramente membros. Alguns pterossauros atingiram tamanhos grandes, com alturas comparáveis às girafas.
Os pterodáctilos parecem estar entre os membros menores do grupo dos pterossauros. No entanto, a partir de 2015, os cientistas não desenterraram nenhum espécime de pterodáctilo adulto fossilizado, então é possível que indivíduos totalmente crescidos excedam a envergadura e o peso atualmente conhecidos. Existem atualmente duas espécies amplamente reconhecidas de pterodactyl: Pterodactylus antiquus e Pterodactylus longicollum. Destes, Pterodactylus longicollum é o maior.