O tratamento para E. coli em cães geralmente envolve injeções para restaurar os fluidos corporais, administração de uma solução de glicose para tratar diarreia e antibióticos, de acordo com o PetMD. A maioria dos cães que contraem E. coli precisará ser hospitalizado e receber tratamento de emergência; como um filhote recém-nascido tem um sistema imunológico subdesenvolvido, o tratamento geralmente é malsucedido em cães dessa idade.
Após o tratamento para E. coli em cães adultos, é necessário restringir a atividade, monitoramento, aquecimento e repouso na gaiola durante o período de recuperação, conforme declarado pelo PetMD. A alimentação com mamadeira ou até mesmo líquidos intravenosos pode ser necessária para garantir que o cão afetado receba as necessidades nutricionais adequadas. Enquanto o cão se recupera, um veterinário pode coletar amostras de sangue do cão para determinar o status de infecção do cão. Uma vez em casa, o cão precisará ser vigiado para detectar quaisquer sintomas de recuo e sua temperatura corporal deverá ser monitorada. O tratamento posterior depende muito do progresso do cão.
Para os filhotes, a forma mais importante de prevenir a E. coli é garantir que eles amamentem e recebam o colostro produzido pela mãe cadela em seu primeiro leite após o nascimento. Trocar a cama para a ninhada também é importante, assim como lavar as mãos antes de manusear filhotes recém-nascidos que ainda estão desenvolvendo seu sistema imunológico.