Os iguanas machos têm grandes músculos da mandíbula que se parecem com papadas e dois depósitos de gordura em suas testas, tornando as cabeças dos iguanas machos maiores e mais grossas do que as fêmeas. O macho também tem um corpo maior e mais pesado e uma protuberância perto da base da cauda, onde seus órgãos reprodutivos estão localizados.
Os iguanas machos também têm poros femorais muito visíveis na parte interna das coxas. Leva de 18 a 24 meses para que uma iguana esteja madura o suficiente para determinar se é macho ou fêmea. Quando a iguana atinge de 15 a 25 centímetros de comprimento, do focinho à cloaca, aparecem características sexuais secundárias.
