A interface da linha de comando é uma interface somente texto que é diferente de uma interface gráfica do usuário. Algumas desvantagens da interface de linha de comando são uma curva de aprendizado íngreme, pequena margem para erros, o grande número de comandos e a incapacidade de descobrir algo por meio da exploração.
A linha de comando tem uma curva de aprendizado íngreme. Como a linha de comando é uma interface somente de texto, pode ser intimidante para muitos novos usuários porque não há instruções para um usuário sem experiência. A linha de comando também deixa uma pequena margem para erros. Se um comando for digitado incorretamente, o computador não será capaz de processar o comando corretamente. Além disso, quando ocorre um erro, os usuários geralmente precisam recomeçar do início do processo.
A linha de comando possui um grande número de comandos. Mesmo para usuários experientes, isso pode ser uma desvantagem. A interface da linha de comando pode desencorajar a exploração. Os usuários não podem simplesmente clicar em um menu e tentar encontrar um comando na linha de comando. Uma interface gráfica de usuário permite que os usuários naveguem por um sistema sem precisar conhecer nenhum comando. A linha de comando tem várias vantagens importantes, incluindo a pequena quantidade de memória de acesso aleatório necessária para executar a linha de comando e a capacidade de um computador funcionar sem o sistema operacional Windows.