Os peixes-boi vivem em oceanos e rios. Sua distribuição abrange a região tropical do Atlântico. As três espécies de peixes-boi vivem ao longo da costa leste das Américas e no Caribe, na bacia do rio Amazonas e na África Ocidental, respectivamente.
A espécie de peixe-boi mais conhecida é o peixe-boi das Índias Ocidentais. O peixe-boi da Flórida é na verdade uma subespécie das Índias Ocidentais. O peixe-boi das Índias Ocidentais vive nas águas quentes da costa da América Central, nos rios da região sudeste dos Estados Unidos e no oceano aberto ao redor das Índias Ocidentais.
Os peixes-boi amazônicos são animais inteiramente de água doce que vivem em rios e riachos lentos no Brasil, Peru, Equador e Guiana.
Os peixes-boi da África Ocidental são as espécies menos conhecidas. Eles vivem ao longo da costa da África Ocidental e em vários rios do interior. Eles foram encontrados no interior até o Chade, que não tem litoral.