Embora o FDA não tenha liberado nenhum desinfetante líquido que use álcool como seu agente primário para uso em ambientes clínicos, o álcool isopropílico provou ser eficaz em matar microorganismos sob certas condições, de acordo com os Centros para Controle e Prevenção de Doenças. Entre os diferentes tipos de álcool disponíveis para esterilização, o álcool isopropílico é consistentemente um dos mais bactericidas.
Conforme relatado pelo CDC, os ensaios clínicos foram conduzidos com álcool metílico, álcool etílico e álcool isopropílico para determinar sua eficácia relativa na esterilização de superfícies. Todas as formas de álcool sofreram uma queda significativa na eficácia quando diluídas em concentrações abaixo de 50 por cento. Nenhum provou ser capaz de matar esporos bacterianos ou penetrar em espessas camadas de proteína. Entre as variedades testadas, no entanto, o álcool isopropílico demonstrou capacidade de matar os vírus tanto da hepatite B quanto do herpes. Foi ligeiramente mais eficaz do que o álcool etílico na desinfecção das populações de E. coli e S. aureus.
Também foi descoberto que o álcool isopropílico foi eficaz na desinfecção de cabeçotes transdutores reutilizáveis. O CDC adverte, entretanto, que germicidas à base de álcool geralmente não são recomendados para esterilizar implementos cirúrgicos. Isso ocorre porque nenhum dos agentes testados foi capaz de eliminar de forma confiável os esporos de vários bacilos, e infecções fatais foram ocasionalmente atribuídas ao uso de implementos tratados com álcool.
