Várias espécies de cobras, incluindo a boa de Cropan, a píton de Ramsay e a boa da Ilha Redonda, estão ameaçadas de extinção desde 2014. As cobras marinhas de nariz curto e escama de folhas que vivem nos recifes de coral ao redor da Austrália também estão criticamente ameaçadas.
As cobras têm poucos predadores naturais que reduzem seus números significativamente, então o perigo de espécies está frequentemente relacionado a causas ambientais. Cobras com áreas relativamente pequenas de habitação, como a jibóia de Cropan brasileira e a cobra liga de San Francisco da América do Norte, são suscetíveis ao perigo, pois os assentamentos humanos invadem seus habitats naturais. A boa da Ilha Redonda ficou gravemente ameaçada de extinção, e sua parente, a boa escavadora da Ilha Redonda foi extinta, quando animais domesticados trazidos para a ilha reduziram drasticamente o número de lagartos, que eram a principal fonte de alimento das cobras.