"Three Skeleton Key" é sobre três homens que trabalham em um farol em uma ilha chamada Three Skeleton Key. Ele se concentra em um incidente em que um navio cheio de ratos bate na ilha e os homens precisam lutar para permanecer vivos.
Os três homens que trabalham no farol são o narrador anônimo, Le Gleo e Itchoua. Eles localizam o navio abandonado conforme ele se aproxima e, em seguida, veem os ratos conforme ele se aproxima. Esses ratos são grandes e ferozes, e os homens supõem que os ratos mataram e comeram a tripulação do navio.
Quando o navio bate na ilha, os homens protegem o farol para manter os ratos longe. Eles passam muitos dias e noites presos e, embora tenham suprimentos, o próximo navio de suprimentos não está programado para chegar dentro de semanas. Eles não podem sinalizar por socorro, pois precisam sair de casa.
O selo em uma janela cede uma noite, e os homens devem lutar contra a horda de ratos. Eles se trancam na sala das lanternas. Sem comida ou água, eles decidem evitar acender a lanterna, o que geralmente só é feito se todos no farol estiverem mortos.
O plano deles eventualmente resulta em eles serem salvos, depois que a guarda costeira ajuda a matar os ratos. No entanto, o incidente deixa Le Gleo louco e Itchoua morre de uma infecção. O narrador decide continuar trabalhando no farol.