Os morcegos na natureza vivem em média de 10 a 20 anos. Isso depende da sobrevivência até a idade adulta; morcegos jovens têm uma alta taxa de mortalidade. Após as primeiras três semanas de vida, eles aprendem a voar, o que aumenta suas chances de sobrevivência.
Descobriu-se que um morcego individual de uma espécie de morcego pequeno marrom, Myotis lucifugus, viveu por quase 40 anos, o que é um número considerável de valores discrepantes da expectativa de vida média dos morcegos. Os biólogos geralmente concordam que os morcegos sobrevivem a outros mamíferos de tamanho comparável, como roedores e primatas. Os morcegos são suscetíveis a algumas predações e parasitas fúngicos, como Pseudogymnoascus destructans, que se acredita causar uma doença chamada síndrome do nariz branco.
