O conflito principal em "Freak The Mighty" são as batalhas de dois meninos entre si e suas respectivas deficiências. Kevin tem um intelecto extraordinário, mas foi aleijado desde o nascimento e usa aparelho ortopédico. Max é fisicamente poderoso, mas mentalmente fraco. Juntos, eles aprendem a superar essas deficiências.
Os dois meninos da história tornam-se amigos e aprendem que juntos são mais fortes do que jamais poderiam ser sozinhos. Eles enfrentam os agressores, percebem que podem ser melhores do que eram no passado e aprendem a ser pessoas melhores uns com os outros. Juntos, eles cultivam uma forte amizade e formam o "Freak the Mighty".