Os principais recursos naturais do Quênia incluem pesca, água, florestas, pântanos, biodiversidade e uma variedade de minerais. Esses minerais incluem calcário, pedras preciosas, sal, zinco, gesso, diatomita, calcário e outros.
A base de recursos naturais do Quênia enfrenta ameaças de atividades socioeconômicas, como agricultura, comércio, turismo e assentamentos humanos. O país também enfrenta a poluição da água por resíduos gerados pelo homem, caça furtiva e desmatamento. O uso de fertilizantes químicos e pesticidas também resulta em má qualidade da água. Devido a leis inadequadas sobre o uso da terra e dos recursos naturais, o Quênia tem experimentado uma gestão pobre de recursos e terras, bem como disputas de terra que levaram à desigualdade e à pobreza generalizada.
A geografia do Quênia é composta de planícies baixas que se elevam até as terras altas que dão lugar ao Grande Vale do Rift. Os dois maiores rios do Quênia são o Tana e o Galana, e um planalto fértil fica no lado oeste do país. Pouco mais de 1 por cento da terra é ocupada por culturas permanentes, mas mais de 9 por cento é arável.
O Quênia enfrenta inundações durante as estações chuvosas, bem como secas severas em outras épocas do ano. Também há alguma atividade vulcânica, e a maior parte da geologia do país é dominada por fendas tectônicas ao longo do Grande Vale do Rift.
