Existem vários tipos diferentes de formas de água natural dentro e ao redor das Filipinas, incluindo canais, pântanos, estreitos, golfos, mares, baías, cachoeiras, rios e lagos. Por ser um arquipélago, o país a linha costeira mediria cerca de 10.847 milhas se colocada de ponta a ponta.
As Filipinas fazem fronteira com o Canal de Babuyan ao norte, o Mar da China Meridional a oeste e o Mar das Celebes a sul. Sua costa leste está voltada para o Oceano Pacífico.
Vários rios e lagos interiores nas ilhas também foram formados por várias atividades geológicas.
- Rios: O maior e mais longo rio das Filipinas é o rio Cagayan, no norte de Luzon. Seguindo em tamanho estão o Rio Grande de Mindanao e o Rio Agusan, respectivamente, ambos encontrados em Mindanao. Outros rios notavelmente grandes incluem os rios Bicol, Angat Pampanga, Pasig e Agno em Luzon. O rio mais famoso entre os turistas é o rio subterrâneo Palawan.
- Lagos: a Laguna de Bay em forma de coração é a mais popular; é também o maior lago das Filipinas e o segundo maior lago de água doce do sudeste da Ásia. Outros lagos populares incluem o Lago Taal, Buhi, Bulusan, Naujan, Mainit e Lanao.
- Cachoeiras: As cachoeiras nas Filipinas desempenham um papel muito importante na economia do país por gerar energia; eles também servem como locais de atração turística. A cachoeira mais alta são as Cataratas Limunsudan de dois níveis encontradas em Barangay Bonbonon. É seguido de perto por Maria Cristina Falls. A cachoeira mais famosa das Filipinas é Pagsanjan Falls, localizada em Laguna.