As causas para água marrom e turva podem incluir ferrugem na tubulação, outros problemas relacionados ao ferro, infiltração de superfície e problemas na estrutura do poço. Um diagnóstico adequado requer o teste da água em um laboratório, o que deve ser feito antes que um encanador seja chamado.
A ferrugem é geralmente a causa do problema quando apenas a água quente está descolorida. A ferrugem também pode ser responsável se os canos quente e frio tiverem água marrom, mas isso geralmente acontece quando apenas um encanamento da casa apresenta o problema. Quando o abastecimento de água é fechado e religado, é comum que a ferrugem do encanamento se desloque e torne a água marrom. Outras causas de ferro na água incluem infiltração de água da chuva e corrosão do revestimento do poço de aço.
Inundações, chuva excessiva ou derretimento da neve também podem causar água marrom e turva devido à infiltração da superfície. Esses eventos causam problemas se a tampa do poço não for vedada corretamente ou estiver danificada. Testar o poço para coliformes e bactérias coliformes fecais pode indicar infiltração de superfície porque danos à superfície do poço podem permitir que esses tipos de bactérias entrem.
Um problema com a estrutura do poço ou nível de água também pode ser responsável por água marrom no poço. A bomba do poço pode puxar a lama ou pode estar atingindo a lateral de um poço, o que acontece quando há mudanças no abastecimento ou nível de água.