O muco é produzido pelas membranas especializadas que revestem os órgãos das cavidades do corpo que se abrem para o exterior, como as encontradas nos sistemas respiratório, digestivo e reprodutivo. Embora o muco seja uma secreção que é mais comumente conhecido por sua presença nas cavidades nasal e oral, também é produzido no estômago, esôfago e nas vesículas seminais masculinas. A secreção de muco desempenha um papel vital como meio de proteção e transporte nas funções internas dos sistemas digestivo, respiratório e reprodutivo de humanos e outros vertebrados.
O muco produzido no sistema respiratório humano protege os pulmões, limitando as partículas estranhas que os atingem. O muco nas passagens nasais e nas vias aéreas retém pequenas partículas, como poeira, alérgenos e bactérias, antes que possam entrar no sistema. Fleuma refere-se a um tipo específico de muco que normalmente está confinado ao trato respiratório. O muco nasal é produzido pelos tecidos que revestem os órgãos das vias aéreas, como os que revestem a traqueia e os bronquíolos. Uma produção contínua de muco nasal hidrata o ar inalado e também evita que as vias aéreas e os tecidos nasais sequem.
No sistema digestivo humano, o muco evita que as paredes celulares do estômago sejam danificadas pela alta concentração de ácido presente no órgão. O esôfago usa muco como lubrificante para ajudar na passagem dos alimentos em seu caminho para o estômago.